伊甸园（EDEN）

一场全球性的大灾难使得人类几乎灭绝。艾诺亚与汉娜两人虽然侥幸存活却难逃被追捕的命运。在这个看似绝望的世界里，今後他们该何去何从？

想有良好的行为；想做正当的事！小时候，大家都是这麽想的。当察觉到的时候，却发现自己总是在做着坏事。为了让自己变强、为了想要救妹妹的艾力亚接受训练……。？

为了希望能让全世界知道这块土地上的人权受到压制，过着贫苦的生活。玛莉含将受到迫害的画面利用通讯卫星转播至全世界。但是没想到对方竟派变形机器人杀尽所有的人…！

玛莉含突然打来一通电话来告知健治说有恐怖份子准备进行爆破，也才得知玛莉含背叛同伴是为了阻止恐怖行动连续发生……！当健治好不容易藉由电话得知玛莉含的所在位置，但没想到已有人设下陷阱……！

埋葬了海雷娜之後，艾力亚便带着人造人雷提娜搭机准备前往澳洲雪梨。但是，他们所搭乘的飞机，却遭军机的飞弹击中爆炸。另一方面，三岛惠人一行人为了找出结晶化後的艾尔斯岩是否还有生还者，并采撷样本，於是便穿着防护衣，冒着生命危险潜入了艾尔斯岩的结晶领域。

爲了查出理查德‧爱鲁德利奇与威鲁海鲁姆公司之间的关系，玛克被派去寻找拉里‧爱巴森以及帕得力克‧钮恩两人…。另一方面，艾力亚带着雷提娜搭机前往澳洲的途中，虽遭军机的飞弹击中爆炸，但两人还是平安抵达。而後，艾力亚得知，原来雷提娜的另一个目的是想见马亚，究竟他们两个人的目的，是否都能达成呢…？

为了破坏埋进玛娜体内的M‧M，艾力亚和米黎亚姆以及雷提雅，各带着不同的目的，来到了凯恩斯寻找乔那山‧法因曼。而在此，他们见到的是如画中般，和乐的一家人，但是，实际上…究竟法因曼能否帮助艾力亚呢…？

原父联邦议长‧甘提，在搭机前往欲访问国家的途中，不幸遭到绑架，究竟绑架他的主谋是谁？其原因又是什麽？另一方面，爲了救出被抓去当人质的玛娜，健治派出了他的弟子‧萝吉，到底她能否救出玛娜，而法因曼又是否能取出玛娜身上的M‧M呢…？

因为苏非亚，不幸败在被自己的抛弃的孩子‧小兰手上，并被带回读取，使得艾力亚一行人，想以潜水艇将玛娜送出去的事曝光，究竟玛娜是否能顺利被送出去，而之後，玛娜以及其他人的命运又将会如何呢…？

世界出现了大规模的地震，各地都受到了相当大的灾害。为了争夺物资，印度教徒跟伊斯兰教徒更是不停地争斗。此外，结晶体也在此时大量产生，人们更宁可放弃现有的生活「进入」结晶体，甚至於卡布利海的位置更出现了一个巨大的结晶体，究竟它会带来什麽样的影响呢…？

健治一行人为了夺回被带走的苏非亚，追着李来到了马尔的摩，李却因不想透露苏非亚的所在之处而自爆身亡，接着他们找上了李的女儿‧小兰。但是却被梅格斯抢先了一步，带走了苏非亚…。此外原父联邦所积极在研究「大圆筒」究竟是否为电梯轨道，它与结晶体又着有什麽样的关系呢…？

（完结篇）马亚利用哈娜，将艾诺亚引诱进了大圆筒，在那里他和想成为「新宇宙」的领导者的梅格斯进行了一场激烈的争斗…另一方面，「高重力磁泡」正逐渐在接近地球，一旦高重力磁泡爆裂，将会给地球带来莫大的危机，究竟地球联邦政府要如何阻止这个危机发生呢？