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幕府未期，京都池田屋袭击事件之夜……年轻的新编组员马庭实行在路上遇到了外国教士，教士留给他一个谜题。虽然实行并不认同教士所说的话，然而宿命却早已牵引着他，迈向不可知的未来。。而人类未来的存亡又与谜题有何关连？小池一夫与池上辽一又一完美力作！「赤鸠」向你报到！
马庭实行根本不能相信自己可能是犹太人的後代！而只剩下半年生命的冲田，则是对一百四十年後人类的存亡有兴趣。於是他们三人前往发现金小牛像残骸的地方，决心解开这个谜底。然而，意料之外的事却发生了…；而那个刻满了汉字的大石碑，究竟隐含着什麽秘密？
实行一行人终於找到黄金小牛像了！没想到黄金小牛像竟然是假的，更令人惊讶的是，古犹太十部族的後代不是日本人，而是中国的秦族，这一连串的结论让大家一时不能接受，於是在冲田去世後，又出发去寻找真正的答案。
高大的别式女生天目丰，竟然爱上了马庭实行！她甘冒生命危险救了实行一行人，更成为寻找十部族的得力伙伴。实行等人因为救了想推翻幕府的阪本龙马而成为众人追杀的对象，重重危机中实行和阿丰更确定了彼此的感情。逃过幕府追杀的三人与阪本龙马道别後，继续寻找十部族的旅程。却在无意中住进黑店，并卷入帮派械斗当中！
死亡商人强多拉为贩卖武器牺牲蜉蝣帮众的性命，愤怒的实行等人改装後杀出重围、为了救出被交换武器的女人们进而潜入敌船。一行人在前往土佐的船旅并非风平浪静；被污辱的女人们想自尽、阿丰怀孕、暴风雨中的实行和海本体会到自己正是「赤鸠」……。此时面前又出现海盗！波折不断的冒险何时才能结束？
漫长的旅程终於要迎向终点，一行人幸运地漂流到土佐的海边，也见到了山内容堂。实行们急欲看见的日本书纪正是在山内容堂的手中，在两相比较之下，日本人是犹太人後裔的可能性越来越高，而南国之民的狙杀行动更确定了这个说法。奔向未来的赤鸠会结束他的冒险吗？波澜壮阔的钜作之完结篇！
